Fortran コンパイラーのインストール

• 履歴
  • 2012/08/12 杉山耕一朗
  • 2013/04/03 小高正嗣, 荻原弘尭

PGI fortran

手引きが <URL:http://www.softek.co.jp/SPG/download/PGI/current/install64.html> にあるのでこれを参照する.

• 事前準備 以下のパッケージをインストールしておく

  # apt-get install gcc-multilib g++multilib gfortran-multilib

• PGI アカウントのアクティベート

  購入するとメールで案内が来るので, それに従ってアカウントをアクティベートする.

• ダウンロード
  • <URL:http://www.softek.co.jp/SPG/ftp.html#linux> よりソフトウェア本体をダウンロード

• インストール

  # export LANG=C
  # mkdir pgi
  # cd pgi
  # tar zxvf pgilinux-12.3.tar.gz
  # ./install
  ...
  (最初にライセンス情報が表示される)
  ...
  Do you accept these terms? (accept,decline) accept
  A network installation will save disk space by having only one copy of the 
  compilers and most of the libraries for all compilers on the network, and
  the main installation needs to be done once for all systems on the network.
  1  Single system install
  2  Network install
  Please choose install option: 1
  
  Installation directory? [/opt/pgi] /work00/pgi
  (注: インストール先は計算ノードと共有するディレクトリにしておく.
  ((<URL:http://www.softek.co.jp/SPG/Pgi/FAQ/faq2.html#010>)) 参照)
  
  Install the ACML? (y/n) y
  ...
  (ACML ライセンス情報が表示される)
  ...
  Do you accept these terms? (accept,decline) accept
  This PGI version links with ACML 4.4.0 by default.  Also available:
  (1) ACML 4.4.0
  (2) ACML 5.1.0
  (3) ACML 5.1.0 using FMA4
  Enter another value to override the default (1) 
  Install CUDA Toolkit Components? (y/n) n
  Install OpenACC compilers? (y/n) n
  Install JAVA JRE 6.0_21? [yes] yes
  ...
  (JAVA のライセンス情報が表示される)
  ...
  Do you accept these terms? (accept,decline) accept
  Do you wish to update/create links in the 2012 directory? (y/n) y
  Remote execution method? (rsh,ssh) ssh
  Do you wish to generate license keys? (y/n) n
  (注: ここではライセンスキーの設定は行わない)
  Do you want the files in the install directory to be read-only? (y/n) n

• ライセンスを取得する (<URL:http://www.softek.co.jp/SPG/Pgi/keyissue.html>)
  • 途中で, 「ホスト名」と「FLEXlm hostid」が必要であるので, 先にソフトウェアを入れておくと良い. /work00/pgi/license.info を参照.
    • hostid は, NIC のハードウェアアドレス
• ライセンスを /work00/pgi/license.dat に置く.

• ライセンスサーバ起動

  # /work00/pgi/linux86/12.3/bin/pgi_license_tool
  If this computer is behind a firewall at your site, please make sure it can
  access the Internet.
  
  1  Generate a license key for this computer
  2  Configure and start a license server on this computer
  3  All of the above
  4  I'm not sure (quit now and re-run this script later,)
  
  What do you want to do? 2
  
  Please enter the location of the license key file.
  /work00/pgi/license.dat
  
  Should license services start when the system boots? (y/n) y
  Master daemon (lmgrd) is not running
  Vendor daemon (pgroud) is not running
  
  The PGI license tool can be re-started by running the script located at
  /work00/pgi/linux86/12.3/bin/pgi_license_tool.
  
  The license key file is located at /work00/pgi/license.dat

• 起動しなかったので以下の修正を行う

  • 起動スクリプト /etc/init.d/lmgrd を以下のように修正

    ### BEGIN INIT INFO
    ...
    # Default-Start:  2 3 4 5 (デフォルトは 3 5)
    # Default-Stop:  0 1 6 (デフォルトでは記載なし)
    ...

  • 以下のコマンドを実行

    # rm /etc/rc3.d/S01lmgrd
    # rm /etc/rc5.d/S01lmgrd
    # update-rc.d lmgrd start 90 2 3 4 5 stop 10 0 1 6

  • FAQ <URL:http://www.softek.co.jp/SPG/Pgi/FAQ/faq3.html#024>を参考に lsb-core パッケージを追加

    # apt-get install lsb-core

• ライセンスサーバ起動テスト

  # /etc/init.d/lmgrd start

  成功すると /opt/pgi/flexlm.log にログが残り, ps コマンドでプロセスが確認できる.

  # ps ax | grep lmgrd
  root     18361  0.0  0.0  16620  1396 pts/2    S    17:34   0:00 /work00/pgi/linux86-64/12.3/bin/lmgrd -c /work00/pgi/license.dat
  root     18362  1.2  0.0  35164  2336 ?        Ssl  17:34   0:00 pgroupd -T hikari.ep.sci.hokudai.ac.jp 11.10 3 -c /work00/pgi/license.dat --lmgrd_start 515be9a8
  root     18442  0.0  0.0   7400   876 pts/2    S+   17:34   0:00 grep lmgrd

• 環境設定

  export PGI=/work00/pgi
  export PATH=$PGI/linux86-64/2012/bin:$PATH
  export PATH=$PGI/linux86/2012/mpi/mpich/bin:$PATH
  export MANPATH=$MANPATH:$PGI/linux86-64/2012/man
  export LM_LICENSE_FILE=$PGI/license.dat

• 動作試験 (1)

  -dryrun -V オプションで実行, 以下のようなメッセージが表示されれば成功.

  $ pgf90 -dryrun -V
  Reading rcfile /opt/pgi/linux86-64/12.4/bin/.pgf90rc
  Reading rcfile /opt/pgi/linux86-64/12.4/bin/nativerc
  Reading rcfile /opt/pgi/linux86-64/12.4/bin/fnativerc
  Reading rcfile /opt/pgi/linux86-64/12.4/bin/x86rc
  Reading rcfile /opt/pgi/linux86-64/12.4/bin/x8664rc
  Reading rcfile /opt/pgi/linux86-64/12.4/bin/lin86rc
  Reading rcfile /opt/pgi/linux86-64/12.4/bin/lin8664rc
  Reading rcfile /opt/pgi/linux86-64/12.4/bin/iparc
  Reading rcfile /opt/pgi/linux86-64/12.4/bin/pgf90rc
  Reading rcfile /opt/pgi/linux86-64/12.4/bin/pgftnrc
  Reading rcfile /opt/pgi/linux86-64/12.4/bin/acc1rc
  Skipping accrc (not found)
  Reading rcfile /opt/pgi/linux86-64/12.4/bin/localrc
  Skipping localrc.dennou-h (not found)
  Skipping siterc (not found)
  Skipping siterc.dennou-h (not found)
  Skipping .mypgirc (not found)
  Skipping .mypgf90rc (not found)
  
  pgf90 12.4-0 64-bit target on x86-64 Linux -tp penryn
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