各種ソフトウェアのビルド
- 履歴
- 2013/04/11 荻原弘尭
Dennou Debian パッケージのインストール
カギの追加
# apt-key adv --keyserver keyring.debian.org --recv 891D7E07
/etc/apt/sources.list の追加
deb http://www.gfd-dennou.org/library/cc-env/Linux/debian-dennou wheezy main deb-src http://www.gfd-dennou.org/library/cc-env/Linux/debian-dennou wheezy main #deb ftp://www.gfd-dennou.org/library/cc-env/Linux/debian-dennou wheezy/ #deb-src ftp://www.gfd-dennou.org/library/cc-env/Linux/debian-dennou wheezy/
update
# apt-get update # apt-get upgrade
single CPU 版
NetCDF のインストール
公式ページから netcdf-3.6.3の srcを取得し, 展開する
$ wget http://www.unidata.ucar.edu/downloads/netcdf/ftp/netcdf-3.6.3.tar.gz $ tar zxvf netcdf-3.6.3.tar.gz $ cd netcdf-3.6.3
環境変数の設定
$ export CC=pgcc FC=pgfortran F90=pgfortran FFLAGS=-fast F90FLAGS=-fast CPPFLAGS=-DpgiFortran
ビルド
$ ./configure --prefix=/usr/local/netcdf-pgi --disable-cxx $ make $ make check # make install
tool の置き換え
# rm /usr/bin/ncdump # rm /usr/bin/ncgen # cd /usr/bin # ln -s /usr/local/netcdf-pgi/bin/ncdump . # ln -s /usr/local/netcdf-pgi/bin/ncgen .
gtool5 (single CPU 版) のインストール
公式ページから ispack の 最新版を取得し, 展開する(最新版は gtool5-20101228-1 2013/04/11 現在)
$ wget http://www.gfd-dennou.org/library/gtool/gtool5/gtool5_current.tgz $ tar zxvf gtool5_current.tgz $ cd gtool5-20101228-1
環境変数の設定
$ export FC=pgfortran SYSFFLAGS=-fast
ビルド
$ ./configure --prefix=/usr/local/gtool5-pgi --with-netcdf=/usr/local/netcdf-pgi/lib/libnetcdf.a $ make $ make test **** All Tests were Successful **** # make install
tool の置き換え
# cd /usr/bin # ln -s /usr/local/gtool5-pgi/bin/gt5frt . # ln -s /usr/local/gtool5-pgi/bin/gt5config .
ispack (single CPU 版) のインストール
公式ページから gtool5 の 最新版を取得し, 展開する(最新版は ispack-1.0.0 2013/04/11 現在)
$ wget http://www.gfd-dennou.org/library/ispack/ispack-1.0.0.tar.gz $ tar zxvf ispack-1.0.0.tar.gz $ cd ispack-1.0.0
README に従い Mkinclude を書きかえる
$ vim ./Mkinclude DIRS = appack bspack ftpack tdpack snpack sopack sppack \ flpack fepack fhpack c2pack p2pack p3pack dkpack \ u2pack pzpack ujpack sjpack \ p3pack-mpi snpack-mpi sppack-mpi sopack-mpi sjpack-mpi LIBNAME = libisp DESTDIR = . STATICLIB = $(DESTDIR)/$(LIBNAME).a SHELL = /bin/sh MAKE = make FC = pgfortran FFLAGS = -fast #FC = ifort #FFLAGS = -xAVX -openmp MPIFC = mpif90 MPIFFLAGS = -fast #MPIFC = mpiifort #MPIFFLAGS = -xAVX -openmp CC = pgcc CFLAGS = -fast DCLFRT = dclfrt AR = ar ARFLAGS = vru RM = rm -f CP = cp CPP = cpp CPPFLAGS = -DDIRECT -DIEEE -DASCII -DLEN AS = as MV = mv -f RANLIB = ranlib CAT = cat #SSE = fort #SSE = sse32 #SSE = sse64 SSE = avx NVCC = nvcc NVCFLAGS = -arch=sm_20 -O3ビルド
$ make
library の設置
# cd /usr/local # mkdir ./ispack # cd ./ispack # mkdir ./lib # cd ./lib # cp ~/ispack-1.0.0/libisp.a ./
spmodel のインストール
公式ページから spmodel の 最新版を取得し, 展開する(最新版は spml-0.7.1 2013/04/11 現在)
$ wget http://www.gfd-dennou.org/library/spmodel/spml_current.tar.gz $ tar zxvf spml_current.tgz $ cd spml-0.7.1
環境変数の設定
$ export FC=pgfortran SYSFFLAGS=-fast
ビルド
$ ./configure --with-netcdf=/usr/local/netcdf-pgi/lib/libnetcdf.a \ --with-gtool5=/usr/local/gtool5-pgi/lib/libgtool5.a \ --with-ispack=/usr/local/ispack/lib/libisp.a \ --prefix=/usr/local/spml-pgi $ make # make install
tool を置く
# cd /usr/bin # ln -s /usr/local/spml-pgi/bin/spmfrt . # ln -s /usr/local/spml-pgi/bin/spmconfig .
MPI 版
NetCDF (MPI 版)のインストール
single CPU 版のインストールのときのディレクトリへ移動
$ cd netcdf-3.6.3
環境変数の設定
$ export CC=mpicc CXX=mpicxx FC=mpif90 F90=mpif90 FFLAGS=-fast F90FLAGS=-fast CPPFLAGS=-DpgiFortran
ビルド
$ ./configure --prefix=/usr/local/netcdf-mpi $ make $ make check # make install
gtool5 (MPI 版)
single CPU 版で持ってきたソースを使用する
$ cd gtool5-20101228-1
環境変数の設定
$ export FC=mpif90 SYSFFLAGS=-fast
ビルド
$ ./configure --prefix=/usr/local/gtool5-mpi --with-netcdf=/usr/local/netcdf-mpi/lib/libnetcdf.a --with-mpiexec=/work00/mpich2/bin/mpiexec $ make $ make test **** All Tests were Successful **** # make install
tool の置き換え
# cd /usr/bin # ln -s /usr/local/gtool5-pgi/bin/gt5frt.mpi . # ln -s /usr/local/gtool5-pgi/bin/gt5config.mpi .
ispack (MPI 版) のインストール
single CPU 版で持ってきたソースを使用する
$ cd ispack-1.0.0
README に従い Mkinclude を書きかえる
$ vim ./Mkinclude DIRS = appack bspack ftpack tdpack snpack sopack sppack \ flpack fepack fhpack c2pack p2pack p3pack dkpack \ u2pack pzpack ujpack sjpack \ p3pack-mpi snpack-mpi sppack-mpi sopack-mpi sjpack-mpi LIBNAME = libisp DESTDIR = . STATICLIB = $(DESTDIR)/$(LIBNAME).a SHELL = /bin/sh MAKE = make FC = mpif90 FFLAGS = -fast #FC = ifort #FFLAGS = -xAVX -openmp MPIFC = mpif90 MPIFFLAGS = -fast #MPIFC = mpiifort #MPIFFLAGS = -xAVX -openmp CC = mpicc CFLAGS = -fast DCLFRT = dclfrt AR = ar ARFLAGS = vru RM = rm -f CP = cp CPP = cpp CPPFLAGS = -DDIRECT -DIEEE -DASCII -DLEN AS = as MV = mv -f RANLIB = ranlib CAT = cat #SSE = fort #SSE = sse32 #SSE = sse64 SSE = avx NVCC = nvcc NVCFLAGS = -arch=sm_20 -O3ビルド
$ make
library の設置
# cd /usr/local # mkdir ./ispack-mpi # cd ./ispack-mpi # mkdir ./lib # cd ./lib # cp ~/ispack-1.0.0/libisp.a ./
spmodel のインストール
single CPU 版のインストールのときのディレクトリへ移動
$ cd spml-0.7.1
環境変数の設定
$ export FC=mpif90 SYSFFLAGS=-fast
ビルド
$ ./configure --with-netcdf=/usr/local/netcdf-mpi/lib/libnetcdf.a \ --with-gtool5=/usr/local/gtool5-mpi/lib/libgtool5.a \ --with-ispack=/usr/local/ispack-mpi/lib/libisp.a \ --with-mpifc=/work00/mpich2/bin/mpif90 \ --prefix=/usr/local/spml-mpi $ make # make install
tool を置く
# cd /usr/bin # ln -s /usr/local/spml-pgi/bin/spmfrt . # ln -s /usr/local/spml-pgi/bin/spmconfig .